پروژه‌ها

ابزارهایی برای تحلیل مجموعهٔ گیرنده‌های ایمنی و مدل‌سازی دوز دارو، در کنار یک پروژهٔ پیشین دربارهٔ جست‌وجو در بازی. هر صفحه، پیاده‌سازی، شواهد و سهم من را توضیح می‌دهد.

سه پروژهٔ آزمایشگاهی از نیازها و طراحی پژوهشی مشترک در ComputImm شکل گرفته‌اند. پیاده‌سازی و استقرار نرم‌افزارها را من انجام داده‌ام.

ایمنی‌شناسی محاسباتی

ClonoDefs

گروه‌بندی توالی گیرنده‌ها با پنج تعریف عملیاتی و خروجی‌های قابل‌ردیابی.

Python · AIRR

جزئیات پروژه مخزن کد

یادگیری ماشین زیست‌پزشکی

DuoDose

مدل‌سازی توزیع جفت‌دوزهای ممکن با توجه به زمینهٔ سلولی و مهار هدف.

Python · PyTorch

جزئیات پروژه مخزن کد

زیرساخت زیست‌اطلاعاتی

C++ IgBLAST Wrapper

اجرای خط فرمان IgBLAST انسانی با منابع همراه و فیلدهای مشتق‌شدهٔ AIRR.

C++17 · CMake

جزئیات پروژه مخزن کد

کار مستقل پیشین

TRON MCTS

عامل C++ مبتنی بر جست‌وجوی درختی مونت‌کارلو، با رابط بازی Qt/UDP.

C++20 · Qt · UDP

جزئیات پروژه مخزن کد

عامل جست‌وجو و رابط بازی، کار مستقل من است؛ سکوی بازیِ درس که همراه مخزن آمده، جداگانه معرفی شده است.